Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNLQ96KJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSLNLQ96KJ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNLQ96KJ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNLQ96KJ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms