Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMX3Q96JJ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMX3Q96JJ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMX3Q96JJ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TMX3Q96JJ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
TMX3Q96JJ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMX3Q96JJ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMX3Q96JJ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMX3Q96JJ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMX3Q96JJ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms