Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM41AQ96HV5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM41AQ96HV5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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