Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAP3Q96FM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP3Q96FM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGAP3Q96FM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAP3Q96FM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms