Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC39Q96DD0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC39Q96DD0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms