Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
OPTNQ96CV9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OPTNQ96CV9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPTNQ96CV9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms