Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSUN4Q96CB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSUN4Q96CB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NSUN4Q96CB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms