Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP3Q969Y2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3Q969Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms