Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT9Q92600 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms