Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
COPS9Q8WXC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms