Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKAP2Q8WWK9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP2Q8WWK9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms