Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC4Q8WW27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms