Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTRT2Q8TDY3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT2Q8TDY3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT2Q8TDY3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT2Q8TDY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT2Q8TDY3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT2Q8TDY3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT2Q8TDY3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT2Q8TDY3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT2Q8TDY3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms