Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI38

NFKBID, NF-kappa-B inhibitor delta, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIDQ8NI38 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIDQ8NI38 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIDQ8NI38 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIDQ8NI38 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms