Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD8Q8NEN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD8Q8NEN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD8Q8NEN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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