Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTL3Q8N8U3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL3Q8N8U3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL3Q8N8U3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms