Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MSL3Q8N5Y2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSL3Q8N5Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms