Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF175Q8N4F7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF175Q8N4F7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF175Q8N4F7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms