Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
C17orf53Q8N3J3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C17orf53Q8N3J3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms