Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP9Q8IXQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP9Q8IXQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms