Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM42Q8IWZ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM42Q8IWZ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM42Q8IWZ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM42Q8IWZ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms