Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKAP1Q86WV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKAP1Q86WV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms