Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP9Q7RTR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms