Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q71RC1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q71RC1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q71RC1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q71RC1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q71RC1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q71RC1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q71RC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q71RC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q71RC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q71RC1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q71RC1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q71RC1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q71RC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q71RC1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q71RC1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q71RC1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q71RC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q71RC1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q71RC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q71RC1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q71RC1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q71RC1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q71RC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q71RC1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q71RC1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q71RC1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q71RC1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q71RC1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q71RC1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q71RC1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q71RC1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms