Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT7Q6ZNI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT7Q6ZNI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT7Q6ZNI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms