Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C16orf54Q6UWD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms