Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNCKQ6P2M8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNCKQ6P2M8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms