Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200BQ69YZ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200BQ69YZ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200BQ69YZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms