Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
E4F1Q66K89 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4F1Q66K89 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms