Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT79Q5XKE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT79Q5XKE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT79Q5XKE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms