Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EFCAB2Q5VUJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
EFCAB2Q5VUJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
EFCAB2Q5VUJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
EFCAB2Q5VUJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms