Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01545Q5VT33 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1102.3 ms