Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PXDC1Q5TGL8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PXDC1Q5TGL8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms