Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
C10orf55Q5SWW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C10orf55Q5SWW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms