Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRMS1LQ5PSV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1LQ5PSV4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1LQ5PSV4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 832.5 ms