Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO47Q5MNV8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FBXO47Q5MNV8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FBXO47Q5MNV8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO47Q5MNV8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO47Q5MNV8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO47Q5MNV8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO47Q5MNV8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO47Q5MNV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms