Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80DQ53TQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80DQ53TQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80DQ53TQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms