Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM3Q53FZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms