Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KHDC1Q4VXA5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KHDC1Q4VXA5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KHDC1Q4VXA5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms