Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A4Q4VNC1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms