Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM176BQ3YBM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM176BQ3YBM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms