Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms