Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM16Q2WEN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM16Q2WEN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM16Q2WEN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM16Q2WEN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM16Q2WEN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM16Q2WEN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM16Q2WEN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM16Q2WEN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms