Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO4Q2I0M5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO4Q2I0M5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO4Q2I0M5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms