Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
COL24A1Q17RW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
COL24A1Q17RW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
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