Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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EXT1Q16394 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXT1Q16394 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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EXT1Q16394 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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EXT1Q16394 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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EXT1Q16394 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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EXT1Q16394 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXT1Q16394 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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