Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF1Q15637 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF1Q15637 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF1Q15637 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF1Q15637 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF1Q15637 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF1Q15637 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SF1Q15637 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF1Q15637 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF1Q15637 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF1Q15637 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF1Q15637 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF1Q15637 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF1Q15637 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF1Q15637 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF1Q15637 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SF1Q15637 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF1Q15637 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF1Q15637 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF1Q15637 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SF1Q15637 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF1Q15637 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF1Q15637 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SF1Q15637 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF1Q15637 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF1Q15637 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SF1Q15637 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF1Q15637 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF1Q15637 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF1Q15637 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF1Q15637 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SF1Q15637 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF1Q15637 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF1Q15637 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF1Q15637 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF1Q15637 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF1Q15637 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF1Q15637 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF1Q15637 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF1Q15637 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF1Q15637 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SF1Q15637 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SF1Q15637 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SF1Q15637 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF1Q15637 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF1Q15637 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF1Q15637 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF1Q15637 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF1Q15637 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF1Q15637 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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