Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR1Q15399 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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