Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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RAB35Q15286 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB35Q15286 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB35Q15286 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB35Q15286 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB35Q15286 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB35Q15286 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB35Q15286 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB35Q15286 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB35Q15286 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB35Q15286 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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