Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA4Q14CN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms